Qonto ist seit Ende November Teil des Partnership Programs von Stripe und damit verifizierter Partner der Payment-Plattform. Qonto-Kunden können damit alle ihre mit Stripe getätigten Transaktionen automatisch mit ihrem Geschäftskonto verknüpfen. Jede Rechnung wird direkt der entsprechenden Transaktion in der Qonto-App zugeordnet und angehängt. Dies soll Zeit sparen und potenzielle Fehlerquellen in der Buchhaltung vermeiden. Weil beide Anwendungen in Echtzeit über ihre jeweilige API miteinander verknüpft sind, liegen alle zertifizierten Zahlungsnachweise unmittelbar und gemäß der Compliance-Richtlinien zur Einreichung beim Finanzamt vor.
Qonto ist eigenen Angaben zufolge europäischer Marktführer im Finanzmanagement für KMUs und Selbstständige und hat rund 200 000 Geschäftskunden in Frankreich, Spanien, Italien und Deutschland.